Giải năm nay quy tụ 40 đội bóng đến từ các trường THPT trên địa bàn Hà Nội. Các đội được chia làm 8 bảng đấu, đá vòng tròn tính điểm. Hai đội nhất ở mỗi bảng sẽ giành quyền vào vòng tứ kết. Năm nay, lần đầu tiên giải có sự xuất hiện của các cầu thủ ngoại đến từ trường Quốc tế UNIS.

Giải Fans Clubs Tournament - Cúp báo Bóng đá 2006 là giải đấu dành cho các cổ động viên yêu thích trái bóng tròn, hâm mộ các đội tuyển tên tuổi trong nước và quốc tế của Thủ đô như: Thể công, SLNA, AC Milan, Arsenal, Red Devils, DEC Barca, Croatia... Lần đầu tiên đại diện cho các đội tuyển lừng danh trên thế giới, 12 đội bóng tham dự đã có cho mình sự chuẩn bị cả về kỹ chiến thuật và tâm lý thi đấu.

Đến với Hội thi năm nay có 394 VĐV đến từ 30 tỉnh, thành, ngành trên toàn quốc. Các VĐV được chia theo lứa tuổi (từ 35 tuổi đến trên 70 tuổi đối với nữ; từ 35 tuổi đến trên 75 tuổi đối với nam), dự thi ở 9 nội dung (50m tự do, 100m tự do, 200m tự do, 50m ngửa, 100m ngửa, 50m ếch, 100m ếch, 200m ếch và 50m bướm).

Mục đích của giải Bóng rổ năm nay, ngoài việc tạo một sân chơi mới cho sinh viên Thủ đô còn phát hiện những nhân tố mới bổ sung vào đội tuyển Bóng rổ sinh viên Việt Nam để tham dự vào các giải đấu quốc tế ở giai đoạn tiếp theo. Ngay sau Lễ khai mạc diễn ra 4 trận đấu của 2 bảng đã thu hút lượng khán giả là sinh viên của các trường yêu thích môn Bóng rổ đên cổ vũ động viên các cầu thủ thi đấu với tinh thần "chiến thắng trong thi đấu thành công trên giảng đường".

So với Đại hội lần thứ 1 diễn ra tại Tp. Cần Thơ (năm 2005) thì tại Đại hội TDTT lần này được tổ chức quy mô hơn với lực lượng tham gia tăng 747 VĐV và tăng 5 môn thi đấu. Đại hội TDTT khu vực lần thứ 3 sẽ diễn ra vào năm 2009, do tỉnh Đồng Tháp đăng cai và các đoàn thể thao đều thống nhất nên có sự tham gia của Đoàn Thể thao Quân khu 9 trong các lần Đại hội.